為了在化學多樣性、藥庫大小、藥庫製備的成本之間取得一個平衡點，研究者開始使用劃分層提取物(fractions)進行高通量篩選。將粗萃取物進一步分成數十個至上百個劃分層，由於小量製備便已足夠用於藥庫建置，因此藥庫製備速度得以提高，且藥庫內的樣品量也有一定的數量，也讓這種劃分層提取物藥庫相當適合使用高通量篩選進行生物活性測試。而這些劃分層提取物內所含的化合物種類相對於粗萃物要單純許多，若能配合上靈敏的核磁共振技術，就能直接鑑定該劃分層提取物內可能的活性成分結構，解決化合物分離和結構解析的瓶頸問題。
本團隊藉由生物資源整合與建置計畫II的補助，開始建立劃分層提取物藥庫，我們將一個植物的粗萃取物，利用水以及正己烷分別去除高與低極性的成分，剩餘的萃取物在進一步細分成96個劃分層，最後將這些劃分層提取物製備成為藥庫。
本藥庫的植物來源包含辜嚴倬雲植物保種中心、印尼、越南當地藥草、台灣民間用藥植物以及中藥藥用植物，共57個不同的植物材料，共有5,472個劃分層提取物。
