ABOUT 天然物藥開發新契機
一直以來,天然物就是藥物開發的重要來源。在人類基因體尚未解碼以及高通量篩選技術仍未發展的時代,有超過80%的新藥來自於天然物或天然物的衍生物。但隨著高通量技術的發展,新藥開發轉向了以組合化學為來源的小分子化學合成藥庫。組合化學能夠快速地提供大量的小分子化合物,這類型的藥庫內含有的小分子化合物數量多在1萬種以上,甚至到數十萬種,因此在1990年代,美國FDA通過的新結構藥物(new molecular entity (NME))來自於天然物的比例明顯下降。但是過去的實務經驗中也發現:組合化學所製造的小分子化合物藥庫配合高通量篩選的策略,在先導藥物開發的成功率似乎仍無法正比於藥廠所投入的開發資源。許多大型篩選的結果令人失望,研究者也理解了「與生物活性相關的化學空間 (chemical space)多樣性」比化學藥庫的大小(化合物數量)更為重要。
此外,分析1984-2014年FDA所通過的新藥物會發現,就算這段期間中新藥開發策略偏向純化學合成小分子藥物為主,純化學合成的小分子新藥比率仍只有27%;相對的,天然物、天然物衍生物或是藥效基團(pharmacophore)的結構是來自或是源自於天然物的合成小分子藥物等等與天然物相關新藥,再加上植物新藥(通常為幾種化合物的混合物) ,全部的比率約占51%。這個結果也顯示天然物仍然是新藥開發中無法取代的資源。而其中一個決定性的因素就是天然物具有多樣化的藥效基團與高複雜度的立體化學。而這樣的特性也讓天然物在新藥開發中占一席之地。
詳細計畫簡介
SERVICE服務項目
- 服務代碼服務名稱服務內容
- NPS-1篩選諮詢評估使用者需求、篩選標的、篩選方法、及實驗設計策略。
- NPS-2平台建立協助已有篩選標的,但尚未開發出篩選方法的使用者建立篩選平台。
- NPS-3平台優化協助已有篩選平台的使用者進行優化,尋找進行高通量篩選時的實驗條件。使用者必須提供必要之實驗材料。
- NPS-4藥庫使用
- NPS-4-1.1藥庫使用-台灣本土植物萃取物庫A (共3,400粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-1.2藥庫使用-台灣本土植物萃取物庫B (共2,544粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-1.3藥庫使用-台灣本土植物萃取物庫C (共1,680粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-1.4藥庫使用-台灣本土植物萃取物庫D (共816粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-2.1藥庫使用-辜嚴倬雲植物保種中心-辜成允植物萃取物庫A (共2,874粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-2.2藥庫使用-辜嚴倬雲植物保種中心-辜成允植物萃取物庫B (共2,160粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-2.3藥庫使用-辜嚴倬雲植物保種中心-辜成允植物萃取物庫C (共1,440粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-2.4藥庫使用-辜嚴倬雲植物保種中心-辜成允植物萃取物庫D (共720粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 10mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-3.1藥庫使用-植物精製提取物藥庫A (共5,472個精製提取物)以96孔盤形式,提供濃度為 1mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-3.2藥庫使用-植物精製提取物藥庫P (每植物有96個精製提取物)以96孔盤形式,提供濃度為 1mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-4藥庫使用-可供食品使用植物萃取物庫 (共344粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 1mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-5藥庫使用-中藥飲片水萃物庫 (共66粗萃取物)以96孔盤形式,提供濃度為 1mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-6藥庫使用-中藥基準方萃取物庫 (製備中尚未開放)以96孔盤形式,提供濃度為 1mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-4-7藥庫使用-人源腸道新興益菌代謝物庫 (製備中尚未開放)以96孔盤形式,提供濃度為 1mg/mL的萃取物,2uL/extract/well 給使用者。
- NPS-5驗證用樣本提供濃度為 10mg/mL,一般提供4uL/extract,最多提供20uL/extract。
- NPS-6高通量篩選代工(超過3000個樣本)使用者必須提供必要之實驗材料,由核心完成篩選實驗,並提供完整篩選數據及篩選出之植物/劃分層清單,並媒合相關之化學團隊。
- NPS-7活性分析
- NPS-7-1細胞內脂滴堆積試驗 (LD assay)• 利用螢光影像方式偵測
• 測試內含6個正負控制組樣本 - NPS-7-2NRF2報導子試驗• 利用冷光方式偵測
• 正負控制組樣本額外計價 - NPS-7-3流感神經胺酸酶抑制試驗 (NA inhibition assay)• 利用螢光方式偵測
• 測試內含6個正負控制組樣本
• 成本內含流感病毒製備 - NPS-7-4流感病毒誘發細胞病變抑制試驗 (Cytopathic effect inhibition assay)• 利用螢光影像方式偵測
• 測試內含正負控制組樣本
• 成本內含流感病毒製備、病毒效價測定 - NPS-7-5抗菌試驗 (目前僅提供 Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus)• 利用吸收光方式偵測
• 測試內含正負控制組樣本 - NPS-7-6細胞毒殺試驗• 利用兩種螢光影像方式偵測
• 可提供DNA含量分析 - NPS-7-7抑制星狀細胞活化試驗• 利用基因表現方式偵測
• 需使用活化誘發劑 - NPS-7-8抑制巨噬細胞活化試驗• 偵測NO含量
• 需使用活化誘發劑
• 測試內含正負控制組樣本 - NPS-7-9NF-κB報導子試驗(NF-κB reporter assay)• 利用冷光方式偵測
• 測試內含正負控制組樣本 - NPS-7-10IL6啟動子報導子試驗(IL6-promoter reporter assay)• 利用螢光影像方式偵測
• 測試內含正負控制組樣本 - NPS-7-11活體外抗登革熱病毒藥物篩選平台與本校新藥開發暨價創中心合作
- NPS-7-12活體外抗茲卡病毒藥物篩選平台與本校新藥開發暨價創中心合作
- NPS-7-13細菌β-葡萄醣醛酸酶 (β- Glucuronidase)功能性分析平台與本校新藥開發暨價創中心合作
- NPS-7-14客製化活性分析
- NPS-8質譜與分子網絡分析
- NPS-9分離與純化
- NPS-10基因毒性分析
- NPS-10-1沙門菌逆突變試驗(Ames Test)• 初步測試:使用兩隻菌株(TA98及TA100)在有/無S9的情形下做測試,每個情形包含7個濃度,每個劑量1盤。
• 完整試驗:本試驗包含劑量範圍研究(初步測試)、陽性對照組、陰性對照組及性狀測試等判斷有效試驗標準機制及五隻試驗菌株(TA98, TA100, TA102, TA1535, 及TA1537)在有/無S9混合液下進行試驗,每個情形包含5個濃度,每個濃度3重複的正式研究。 - NPS-10-2彗星試驗(Comet Assay)服務(預計113年度提供)